Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms