Protein–RNA interactions for Protein: P62838

Ube2d2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2P62838 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d2P62838 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d2P62838 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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