Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms