Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps18P62270 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps18P62270 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps18P62270 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps18P62270 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps18P62270 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps18P62270 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms