Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp46P62069 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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