Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Lmo4P61969 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Lmo4P61969 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Lmo4P61969 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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Lmo4P61969 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lmo4P61969 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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