Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms