Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abce1P61222 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abce1P61222 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abce1P61222 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abce1P61222 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms