Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ActbP60710 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ActbP60710 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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ActbP60710 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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ActbP60710 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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ActbP60710 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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ActbP60710 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ActbP60710 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms