Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcbp1P60335 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms