Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl3P58873 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms