Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tubgcp3P58854 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tubgcp3P58854 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tubgcp3P58854 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tubgcp3P58854 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tubgcp3P58854 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Tubgcp3P58854 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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