Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd4P58467 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd4P58467 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms