Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtdsplP58465 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtdsplP58465 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms