Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms