Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bace1P56818 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bace1P56818 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bace1P56818 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bace1P56818 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bace1P56818 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bace1P56818 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bace1P56818 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bace1P56818 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms