Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TdgP56581 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TdgP56581 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TdgP56581 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TdgP56581 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TdgP56581 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TdgP56581 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TdgP56581 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TdgP56581 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TdgP56581 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TdgP56581 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TdgP56581 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TdgP56581 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TdgP56581 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TdgP56581 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TdgP56581 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TdgP56581 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TdgP56581 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TdgP56581 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TdgP56581 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TdgP56581 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TdgP56581 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TdgP56581 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TdgP56581 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TdgP56581 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TdgP56581 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TdgP56581 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TdgP56581 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TdgP56581 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TdgP56581 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TdgP56581 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TdgP56581 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TdgP56581 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TdgP56581 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TdgP56581 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms