Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms