Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CartptP56388 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CartptP56388 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CartptP56388 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CartptP56388 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CartptP56388 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CartptP56388 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CartptP56388 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CartptP56388 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CartptP56388 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CartptP56388 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CartptP56388 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CartptP56388 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CartptP56388 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CartptP56388 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CartptP56388 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CartptP56388 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CartptP56388 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CartptP56388 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CartptP56388 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CartptP56388 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CartptP56388 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CartptP56388 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CartptP56388 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CartptP56388 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CartptP56388 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CartptP56388 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CartptP56388 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CartptP56388 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CartptP56388 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms