Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PctpP53808 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PctpP53808 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PctpP53808 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PctpP53808 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PctpP53808 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PctpP53808 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PctpP53808 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PctpP53808 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PctpP53808 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PctpP53808 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PctpP53808 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PctpP53808 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PctpP53808 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PctpP53808 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PctpP53808 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PctpP53808 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PctpP53808 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PctpP53808 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PctpP53808 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PctpP53808 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PctpP53808 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PctpP53808 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PctpP53808 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PctpP53808 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PctpP53808 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PctpP53808 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PctpP53808 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PctpP53808 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PctpP53808 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PctpP53808 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PctpP53808 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PctpP53808 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms