Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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