Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Map3k1P53349 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms