Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms