Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt6aP50446 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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