Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpreP49446 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms