Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms