Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LmnaP48678 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LmnaP48678 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LmnaP48678 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LmnaP48678 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms