Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms