Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms