Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NodalP43021 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NodalP43021 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NodalP43021 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NodalP43021 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NodalP43021 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NodalP43021 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NodalP43021 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NodalP43021 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NodalP43021 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NodalP43021 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NodalP43021 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NodalP43021 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NodalP43021 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NodalP43021 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NodalP43021 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NodalP43021 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NodalP43021 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NodalP43021 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NodalP43021 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NodalP43021 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NodalP43021 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NodalP43021 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NodalP43021 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NodalP43021 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NodalP43021 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NodalP43021 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NodalP43021 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NodalP43021 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NodalP43021 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NodalP43021 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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