Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtlP38585 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtlP38585 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TtlP38585 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TtlP38585 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
TtlP38585 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TtlP38585 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TtlP38585 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TtlP38585 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtlP38585 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtlP38585 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtlP38585 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtlP38585 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms