Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgclP38060 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgclP38060 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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