Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprkP35822 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprkP35822 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprkP35822 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprkP35822 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprkP35822 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PtprkP35822 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprkP35822 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms