Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TpoP35419 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TpoP35419 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TpoP35419 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TpoP35419 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TpoP35419 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TpoP35419 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TpoP35419 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TpoP35419 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TpoP35419 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TpoP35419 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TpoP35419 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TpoP35419 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TpoP35419 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TpoP35419 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TpoP35419 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TpoP35419 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TpoP35419 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TpoP35419 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TpoP35419 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TpoP35419 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TpoP35419 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TpoP35419 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TpoP35419 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TpoP35419 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TpoP35419 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TpoP35419 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TpoP35419 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TpoP35419 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms