Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpardP35396 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpardP35396 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PpardP35396 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PpardP35396 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PpardP35396 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpardP35396 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpardP35396 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpardP35396 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpardP35396 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpardP35396 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpardP35396 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpardP35396 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpardP35396 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpardP35396 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpardP35396 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpardP35396 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpardP35396 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpardP35396 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpardP35396 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpardP35396 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpardP35396 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpardP35396 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PpardP35396 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpardP35396 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpardP35396 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpardP35396 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpardP35396 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PpardP35396 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpardP35396 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpardP35396 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PpardP35396 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpardP35396 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpardP35396 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpardP35396 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpardP35396 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpardP35396 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpardP35396 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpardP35396 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpardP35396 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpardP35396 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpardP35396 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpardP35396 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpardP35396 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpardP35396 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PpardP35396 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpardP35396 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PpardP35396 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpardP35396 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpardP35396 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpardP35396 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpardP35396 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpardP35396 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpardP35396 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpardP35396 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpardP35396 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpardP35396 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpardP35396 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpardP35396 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpardP35396 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms