Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms