Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccnd3P30282 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms