Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms