Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms