Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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