Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxraP28700 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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RxraP28700 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxraP28700 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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