Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms