Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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