Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb3P28231 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms