Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afxP27661 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afxP27661 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afxP27661 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afxP27661 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afxP27661 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afxP27661 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afxP27661 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms