Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xrcc5P27641 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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