Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms