Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HdcP23738 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HdcP23738 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HdcP23738 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HdcP23738 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HdcP23738 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HdcP23738 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HdcP23738 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HdcP23738 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HdcP23738 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HdcP23738 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HdcP23738 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HdcP23738 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HdcP23738 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HdcP23738 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HdcP23738 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HdcP23738 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HdcP23738 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HdcP23738 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HdcP23738 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HdcP23738 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HdcP23738 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HdcP23738 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HdcP23738 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HdcP23738 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HdcP23738 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HdcP23738 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HdcP23738 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HdcP23738 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HdcP23738 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HdcP23738 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HdcP23738 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HdcP23738 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HdcP23738 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HdcP23738 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HdcP23738 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HdcP23738 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HdcP23738 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HdcP23738 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HdcP23738 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HdcP23738 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HdcP23738 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HdcP23738 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HdcP23738 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HdcP23738 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HdcP23738 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HdcP23738 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HdcP23738 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HdcP23738 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HdcP23738 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HdcP23738 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HdcP23738 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HdcP23738 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HdcP23738 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HdcP23738 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HdcP23738 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HdcP23738 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HdcP23738 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HdcP23738 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HdcP23738 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HdcP23738 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HdcP23738 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HdcP23738 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HdcP23738 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HdcP23738 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HdcP23738 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HdcP23738 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HdcP23738 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HdcP23738 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HdcP23738 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HdcP23738 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HdcP23738 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HdcP23738 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HdcP23738 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms