Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkchP23298 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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