Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tap1P21958 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms